耶拿战役最能反映的是对于政治军事上仍相当封建的普鲁士来说，自由改革的必要性及迫切性。一些普鲁士主要的军事改革家例如沙恩霍斯特、格奈森瑙和克劳塞维茨都曾参与战役。他们的军事改革与之后持续多年的社会改革，开始了普鲁士转变成为现代国家的过程，逐渐将法国的势力逐出德意志，成为欧洲大陆上的领导角色。
德国著名哲学家黑格尔，那时是耶拿大学的教授，在战役激烈进行的时候，他宣布完成了著作《精神现象学》。黑格尔视这次战役为“历史的完结”，即是说人类社会将会趋向我们日后所称的“自由民主制”。
从战略和战术两方面来看，很少有哪次胜利具有的决定性能够与耶拿-奥尔施塔特双重会战相比拟。不过在政治方面，拿破仑却并未能达到他的目的。普鲁士的失败并未使英格兰退出战争，而也正是因为这一点，才使这两个会战在历史上具有广泛的影响。它们没有带来和平，反之在它们之后，欧洲还是连年苦战，终至民穷财尽，结果当拿破仑最后被推翻时，英国的世界霸权也从此奠定了基础。从此英国变成了全世界的工厂和银行，这也正是拿破仑所竭力阻止的事情。
如果与这个后果比较一下，那么一个绝对王权的被推翻，一亿六千万法朗巨额战争赔偿，和萨克森和魏玛被迫加入莱茵同盟，都只能算是次要的事件。拿破仑对这一点也十分明了，因为在他大获全胜之后，马上就想转过身来解决其尚未解决的难题，就是如何消耗英国人的存金和如何最后毁灭英国人的信用。
第一条，他没收了普鲁士和萨克森境内的一切英国货物。 [ 原作者注：在莱比锡，他没收了大量的英国衣料。所以他向每个法国军官赠送一套全新的军服，向每一名士兵赠送一件外套和一件上衣。 ] 其次，他命令莫提尔占领汉堡和汉莎的城镇。最后于11月21日，他发布了他的《柏林敕令》，这就是他准备用来毁灭不列颠贸易的伟大计划。它共有十一条，其中前八条是最重要的，内容可以略述如下：
第一条：不列颠各岛被宣布处于封锁的状态中。
第二条：一切往不列颠各岛的旅行和通信均应禁止。
第三条：所有在我军和联军所占领的国家中，如果发现任何英国臣民，一律当作战俘收容。
第四条：所有仓库、一切商品和一切财产，无论何种性质，只要是属于英国人的，都一律加以没收。
第五条：一切买卖英国商品的商业都在禁止之列，一切属于英国的商品，或是从英国工厂中和殖民地中出来的，都一律宣布为没收的对象。
第六条：一切充公没收的财产中，应提出半数来赔偿因为商船被英国巡洋舰所捕获而受损失的商人。
第七条：自本敕令公布之后，一切直接从英国和其殖民地开来的船只，以及曾经到过该地的船只，一律不准进入欧洲的任何港口。
第八条：一切假借名义，企图违反上述规定的船只，一律加以没收，对于船只本身和所载的货物一律视同英国货来处置。
这个敕令就成为拿破仑政策的奠基石。凡是愿意接受其约束者就成为法国的友人，否则就被当做法国的敌人。英国当然立即发动反击。1807年1月7日，英国发布命令，禁止任何中立国的船只在任何两个法国港口之间或其同盟国的港口之间进行贸易。如果违反这个规定，船只和货物都一律加以没收。为了报复，1月27日，拿破仑命令没收汉莎各镇市中的英国货，连同其殖民地所生产的都在内。这样，真正的战斗就开始了。