本病一般预后良好，但如不及时治疗，也可并发脑膜炎、胰腺炎或影响耳部造成听力损害等。此外，青春期患者感染病邪后往往易出现兼证，男性可并发睾丸肿痛，影响生殖，后患无穷。
对患流行性腮腺炎的儿童，应注意口腔清洁，饮食宜清淡，忌酸性食物，多饮水。对高热、头痛、呕吐者，应给予解热止痛等。对重症患者或同时伴有脑膜炎或睾丸炎者，可考虑用肾上腺皮质激素治疗，以缓解症状。作为西医治疗的有力补充，中药治疗多用清热解毒、软坚消痛等药，局部敷用消肿止痛药。
作为呼吸道感染的常用中药，板蓝根的应用已有2000余年的历史，其在治疗病毒引起的传染病上屡建奇功。板蓝根性味苦、寒，归心、胃经。具有清热解毒、凉血利咽之效，主治热毒炽盛所致之证。《中药大辞典》说其“清热、解毒、凉血，治流感、流脑、乙脑、肺炎、咽肿、痄腮、火眼、疮疹”，充分肯定了它广泛的效用。现代药理研究发现，本品抗菌谱较广，对溶血性链球菌、白喉杆菌、大肠杆菌、伤寒杆菌等均有抑制作用，尚能拮抗肝炎、乙脑、流感、腮腺炎等病毒，并能清除体内热源，修复损伤的免疫细胞，提高机体抗病能力。