中医认为，胡椒有排气的作用，可治疗胸膈胀满、温化寒痰，及受凉引起的腹痛泄泻、食欲不振等。中日友好医院主任医师李佩文说，在治疗这类疾病时，可把胡椒0.6~1.5克研末伴水加红糖吞服，也可用胡椒泡酒抹到胸口外，可治疗因受凉引起的胃痛。此外，把胡椒粒砸碎后，用开水冲，然后与红糖水一起泡2~3天，口服可治疗胃寒引起的胃痛。
胡椒能升高血压，血压偏低的患者可多服用胡椒。但是，由于血压高而导致眼底动脉出血、痉挛的患者则最好不要服用胡椒。明代医学家李时珍就曾在《本草纲目》中写下这样一段话：“胡椒大辛热，纯阳之物……时珍自少食之，岁岁病目，而不疑及也。后渐知其弊，遂痛绝之，病目亦止。”据说，李时珍年轻时经常患眼病，却始终找不出病因。后来渐渐发现年年复发的眼疾，竟与自己平时特别爱吃胡椒有关。于是在停食胡椒一段时间后，眼病就好了。康复后，他又试吃胡椒，很快就觉得双目干涩，视力模糊。为此，李时珍特在《本草纲目》中收录胡椒时予以指出，以示后人。
胡椒还主治因受风寒引起的感冒，李佩文教授曾试过一个偏方，即将胡椒加红糖、姜丝，与可乐一起煮开后服用，对于预防感冒效果很好，口味也佳。
除了上述用法，李佩文教授还特意推荐了两种日常的胡椒药膳用法，一为干吃，即用煎炸的肉食品蘸胡椒末吃；二为湿吃，即当菜汤或肉汤熬好后，趁热撒入胡椒粉，不仅保健，还能闻到特有的香味。