崇陵是光绪死后，才开始修建的，直到到清朝灭亡时，仍尚未建成，后由大臣梁鼎芬向逊清遗老捐集款项，才得以继续修建完成。崇陵地宫虽规制并不宏大，但工料之精、耗银之多，也是相当可观的。墓道有四重石门，每重门由两扇整雕的清白玉石合成。上面有菩萨浮雕一尊。地宫内床为青石雕成的须弥座，上面左右并排停放着光绪皇帝和隆裕皇后的棺椁，棺椁四周鐫刻有藏文和梵文经咒。
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崇陵地宫曾被盗墓，当年的残迹还在，光绪皇帝的棺椁被用刀斧凿成一个大洞，隆裕皇后的棺椁盖也被撬开，珠宝被盗贼取出，地宫内随葬物品被洗劫一空。所幸，盗贼并未发现光绪皇帝棺椁底下的「金井」，后来考古工作者从发现珍珠、翡翠、玉石、子母铁球等珍贵文物二百多件。光绪的死因存疑百年，中国国家清史编纂委员会，歷时5年，通过对光绪头髮、遗骨、衣物进行检测化验，得出结论：「光绪帝死于砒霜中毒」。
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此次检测的光绪遗骨，其中有光绪的头髮2缕，肩胛骨、环椎骨、脊椎骨、肋骨等7块遗骨，以及5件已经残破的衣物。这次对光绪尸骨遗物的检测鉴定，除了清史专家，还有原子能科学研究院、法医检验鉴定中心的专家等，鑑定小组歷时5年，使用精密的科学仪器，对光绪的头髮、遗骨、衣物以及墓内外环境样品等，进行了严格的检测。
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发现光绪的头髮、遗骨以及衣物上，均有浓烈的砷毒素(砒霜)
，其砷含量要比常人高2000多倍。通过模拟试验，专家推断，光绪胃腹部衣物上的砷，是光绪含毒尸体腐败后，直接侵蚀遗留所致，而其衣领部位以及头髮上的大量砷，则是由其含毒尸体腐败后溢流侵蚀所致。至此，百年疑案，终于尘埃落定。