千古一帝秦始皇，他留下的功绩可谓彪炳日月照耀千古，让世人敬仰;同时他留下的谜团可谓云山雾罩神秘莫测，让世人迷惑。最典型的谜团是如下五个：
长相之谜：
《秦始皇本纪》记载秦始皇是塌鼻，长眼，鸡胸，还有气管炎。而《太平御览》则描述秦始皇高鼻子，大眼睛，额骨突起，天庭饱满，身高近2米，腰围1米2。气宇轩昂，风姿伟岸。关于秦始皇的长相没人能说清楚。
身世之谜：
秦始皇的生父是谁，司马迁的记叙相互矛盾。《秦始皇本纪》中说秦始皇是秦庄襄王子异的儿子，《吕不韦列传》却又说秦始皇是吕不韦的儿子。秦始皇的身世之谜，成为二千多年来后人的谈资。
皇后之谜
皇后是母仪天下的第一夫人，然而一直以来，关于秦始皇的皇后，史书上没有半点笔墨，皇后陵也无迹可寻。始皇后此人不存在，还是何种原因不记载，我们已经无从得知。除了皇后之外，秦始皇的后宫在历史上都没有记载。
铜人之谜
秦始皇曾下旨收缴天下兵器，铸造了12个铜人安放在咸阳秦王殿。铜人总重45万公斤，造型之大，工艺之精，世所罕见。但秦始皇为何要造铜人，众说纷纭;铜人如今的下落，也是没人知道。
遗诏之谜
史书记载秦始皇在沙丘宫口授遗诏，让远在上郡的扶苏操办后事，而没有交代给身边的胡亥。但遗诏让扶苏还是胡亥继位?真的被胡亥、李斯和赵高三人篡改了吗?历史真相一直没有解开。