近年来，益生菌制剂几乎成了有病治病、无病健身的神药，有部分专家认为益生菌需要长期定量补充，排除部分商业因素驱动，是否需要长期定量补充还有待确切证据。
联合国粮农组织（FAO）和世界卫生组织（WHO）将益生菌定义为：一定数量摄入能够对人体健康产生益处的活的微生物。其实，益生菌不是某个菌株的名字，而是一个庞大家族的统称，有很多菌株组成。
以下个人意见，不代表医院，商家勿扰。益生菌制剂不是万能药，应该在需要的时候定性定量补充。
人体本身可以自行制造益生菌，有自行调节菌群平衡的能力，需要使用益生菌的情况主要有两种：
一种是长期使用抗生素的人，因为抗生素杀死致病菌的同时也杀死了人体有益菌群，所以需要通过额外补充重新快速建立人体微生态屏障。
一种是严重（长期）腹泻的人，因为腹泻导致肠道内的益生菌大量丢失，所以需要通过额外补充重新快速建立肠道菌群平衡。
比如，便秘、腹泻都可能是肠道菌群失衡，但不是千人一面的，所以最好可以针对菌株进行补充。而益生菌株在达到适合他们生存的结肠之前，先后需要经历胃（酸性环境）和小肠（碱性环境）的消化液和消化酶的考验，所以还要关注菌株的活性和数量……
另外，益生菌制剂可能在普通人群显现更多益处，但在一些免疫功能低下人群，还得注意可能存在感染的风险。