1、感染性因素：现代医学认为，感染是引起本病的主要原因。
2、医源性因素：临床上属医源性引起的肛门直肠周围脓肿并不少见。
①内痔插枯痔丁或注射疗法，因操作不当或药剂不洁感染形成粘膜下脓肿。
②直肠周围注射化学药物刺激，引起组织坏死，造成直肠周围脓肿。
③乙状结肠镜检查，造成腹膜穿孔感染，引起直肠后间隙脓肿。
④局部麻醉感染，或油溶液注入后吸收不良，而形成脓肿。
3、手术后因素：临床上亦可见到肛门直肠手术引起感染，而形成的直肠周围脓肿，以及尿道术后感染、会阴部术后感染、产后会阴破裂缝合后感染等引起的脓肿。
4、其它：直肠内异物损伤后感染，放线菌病，直肠憩室炎感染，肛管直肠癌破溃或波及深部的感染，及身体虚弱，抵抗力低下，或患有慢性消耗性疾病，或营养不良，都是肛门直肠周围脓肿的发病原因。
肛周脓肿这种疾病虽说比较常见，但也是可以做到预防的一种疾病，一般来说，若是患者在平时的生活中，注意身体方面的锻炼，就能大大的增强抗感染的能力，因此，对这方面要足够重视。
1、忌食腥、辣刺激性食物。因为饮食不当可导致大便干燥，干硬的粪便排出时，可以撕破肛瓣和擦伤肛门皮肤、黏膜，使细菌容易从伤口进入肛周组织引起感染形成脓肿。
2、合理调配饮食。日常饮食中可多选用蔬菜、水果、豆类等含维生素和纤维素较多的饮食。