雍正在位时，便把她赐给弘历当侧福晋。弘历即位后封她为娴妃。乾隆十年正月二十三日被封为娴贵妃。乾隆十三年三月孝贤皇后富察氏死后，中宫之位悬缺。当时弘历三十八岁，正值中年，崇庆皇太后钮祜禄氏对于后宫无皇后之事相当关心，见娴贵妃端庄惠下，有母仪之风，劝皇上立娴贵妃为皇后。乾隆因与孝贤皇后婚配多年，感情深厚，乾隆觉得孝贤皇后刚去世不久，尚在大丧期间就册立新后，于心不忍，但为了不违背皇太后的旨意，他采取了一个折衷办法，先在乾隆十三年七月把娴贵妃晋封为皇贵妃，摄六宫事(即代替皇后掌管六宫大小事务)，暂代行皇后职务，等到孝贤皇后的丧期过后，于乾隆十五年八月初二日正式将其册立为新皇后。
册立礼刚举行过半个月，那拉皇后就陪着皇帝展谒祖陵、西巡嵩洛、五台山进香，又下江南巡视。那拉氏春风得意，荣耀非常。乾隆十七年，生皇十二子永璂，次年生皇五女，二十年又生下皇十三子永璟。当时的那拉氏皇恩优渥，倍受宠幸。
乾隆三十年正月，那拉皇后陪乾隆皇帝第四次南巡。这次南巡成了那拉皇后命运的转折点，南巡初期，一切都很正常，在途中，皇帝还为她庆祝四十八岁千秋。闰二月十八日，他们来到杭州，在风景秀丽的“蕉石鸣琴”进早膳时，皇帝还赏赐给皇后许多膳品，但到了当天晚上进晚膳时，皇后就没有再露面，陪着皇帝进晚膳的只有当时还是令贵妃的魏佳氏、庆妃陆氏、和容嫔和卓氏，此后，皇后再也没有露过面。
后来才知道，在闰二月十八日那天，乾隆派额驸福隆安把皇后由水路送回京师，南巡结束，回到京师不久，乾隆帝即下令收回皇后手中的四份册宝，即皇后一份、皇贵妃一份、娴贵妃一份、娴妃一份，裁减了她手下的部份佣人，到了七月份，那拉皇后手下只剩两名宫女，按清宫制度，只有后妃中最低一级的答应才有两名宫女，第二年七月十四日，那拉氏默默离开人世，终年四十九岁，乾隆同时传旨，命丧葬仪式下降一级，即等同于皇贵妃的的制度举行，当年九月二十八日葬入裕陵妃园寝。
乌喇那拉氏虽然被册立为继皇后，得到过皇帝的宠爱，但她在乾隆心目中却远不如前皇后富察氏。其一，乌喇那拉氏所生皇嫡子永璂，一直没有像富察氏所生的永琏、永琮那样被乾隆秘密立为储君，这让她感到焦虑和不安。其二，乾隆心里一直怀念已经作古多年的富察氏，而乌喇那拉氏却相对冷淡，这让她感到伤心和失败。无论是作为皇后，还是作为女人，乌喇那拉氏一直不被乾隆所重视，造成她内心极不平衡。
而南巡途中发生的另一件事情，终于激起乌喇那拉氏内心积压多年的怒火。十七年前，富察氏陪同乾隆东巡时，在济南一病不起，后死于德州。此后，乾隆每次途经济南时，总是避开这座“伤痕城市”，绕城而行。这一次，乾隆还专门为富察氏作诗：“济南四度不入城，恐防一入百悲生。春三月昔分偏剧，十七年过恨未平。”正是这首蕴涵对富察氏苦苦相思的抒情诗句，切实刺痛了乾隆身旁乌喇那拉氏那颗极其要强的心。接下来的“断发”，不过是乌喇那拉氏在情感绝望中一次歇斯底里的爆发。
那拉皇后到底做了什么事，让乾隆立即把她送回京师，并收回四份册宝呢?事后只听说那拉皇后忽然自己剪发，在满族的习俗里头这是最忌讳的，只在皇太后、皇帝驾崩时，皇后才可以剪发，当时的皇太后、皇帝都还健在，那拉皇后却突然剪发，无疑是在诅咒他们一样，在当时引出了一些传闻，说皇后随驾南巡，触犯了龙颜，只得削发为尼，出家到杭州寺庵之中。另外，据有的史书记载，那拉皇后随乾隆南巡来到杭州后，乾隆曾深夜换上便服登岸游玩。
皇后再三劝谏，甚至哭着劝谏，乾隆不仅不听，反而说皇后精神不正常，派人将她送回京师。乾隆是中国史上著名的风流天子，他模仿他的祖父康熙不断南巡，目的却只是贪恋江南美景，又可趁机寻花问柳。
据说他南巡时就曾在清江浦得到一个昭容的女伶，带在身边，后来又特命用钿车锦幰送回扬州，还赐给她玉如意、粉盝、金瓶、绿玉簪、赤瑛、玉杯、珠串等。还有一个女伶名叫雪如，也是美貌多姿，乾隆南巡时又看上她，加入行幄，颇受眷顾。事后，雪如特地在上衣肩头绣上一条小团龙，并且对人说，乾隆皇帝曾经用手抚摩过她的肩膀，因此特绣小龙，以志宠异。
在《东华续录》乾隆朝卷二十二中的一道谕旨中说“皇后自册立以来尚无失德，去年春，朕恭奉皇太后巡幸江浙，正承欢洽庆之时，皇后性忽改常，于皇太后前不能恪守孝道。比至杭州，则举动尤乖正理，迹类疯迷。因令先其回京，在宫调摄。经今一载有余，病势日剧，遂尔庵逝。此实皇后福分浅薄，不能仰承圣母慈眷，长受朕恩礼所致。若论其行事乖违，即予以废黜，亦理所当然，朕仍存其位号，已为格外优容。但饰终典礼不便复循孝贤皇后大事办理。所有丧仪止可照皇贵妃例行。
”
那拉氏一向温柔婉顺，淑慎贤明，夙娴礼教，她出身满洲，在宫中生活了三十多年，什么是国家大忌，她会不知道吗?究竟受了什么重大刺激，会把这位温顺懂礼的皇后逼到不顾触犯国俗大忌，甚至发疯的地步?野史中的传说不能说是空穴来风、无中生有。
在那拉皇后过世之后，当时乾隆在木兰围场打猎，听到皇后病故的消息，只命那拉皇后的儿子永璂回宫。当时有个叫李玉鸣的御史上疏，请依皇后礼举丧，结果竟被谪伊犁。十二年后，又有一个名叫金从善的书生，上书乾隆皇帝，谈到立后之事。
乾隆还为此发怒道：“那拉氏本是我即位前的侧福晋。我即位后，因孝贤皇后病逝，她才循序由皇贵妃又立为皇后。后来她自犯过失，我对她一直优容。国俗最忌剪发，她却悍然不顾，我仍然忍隐，不行废斥。她病死后，也只是减其仪等，并未削去皇后名号。我处理此事已经仁至义尽，况且从此未再立皇后。金从善竟想让我下诏罪已，我有何罪应当自责?他又提出让我立皇后。我如今已经六十八岁了，岂有再册立中宫皇后的道理!”竟因此将金从善处斩，从此之后，就没有人再敢提及那拉皇后的事了。
实际上，那拉皇后的丧礼比皇贵妃的级别还要低，按皇贵妃的丧仪规定，每日应有大臣、公主、命妇齐集举哀、行礼一项，在那拉皇后的丧事中，这项被取消了。那拉皇后既未附葬裕陵，也未单建陵寝，却葬在了妃园寝内，更有甚者，按惯例，凡葬在妃园寝内的，无论地位有多低，都各自为券，而那拉皇后却被塞进了纯惠皇贵妃的地宫，位于一侧，堂堂的皇后反倒成了皇贵妃的下属。
清制：凡妃、贵妃、皇贵妃死后都设神牌，供放在园寝享殿内，祭礼时在殿内举行，而嫔、贵人、常在、答应则不设神牌，祭祀时，把供品桌抬到宝顶前的月台上。而那拉皇后即不设神牌，死后也无祭享，入葬以后也只字不提，比民间百姓的葬礼还不如。